Полное секвенирование экзома
Полное секвенирование экзома (WES, Whole Exome Sequencing) относится к методам молекулярно-генетической диагностики, позволяющим одновременно исследовать большое количество кодирующих последовательностей ДНК. В ходе анализа оцениваются экзонные участки генов, которые содержат информацию для синтеза белков. Исследование не ограничивается заранее определенным перечнем заболеваний или генов и предусматривает анализ экзома в целом. Поэтому в полученных данных могут быть представлены варианты как в генах с хорошо изученной ролью в развитии заболеваний, так и в генах, клиническая значимость которых пока остается недостаточно определенной.
Метод позволяет выявлять различные классы генетических изменений, в частности:
- замены отдельных нуклеотидов, а также изменения, затрагивающие несколько нуклеотидов (SNV и MNV);
- небольшие структурные изменения последовательности ДНК в виде вставок или выпадений фрагментов (indel) протяженностью до 50 пар нуклеотидов;
- изменения дозы генетического материала, относящиеся к категории CNV, включая утраты или дополнительные копии участков генов различного размера.
- возможность выявления таких изменений зависит от характеристик используемой методики и имеет определенные технические ограничения.
Когда рекомендуется проведение WES:
Исследование может использоваться при диагностически сложных случаях, когда стандартное обследование и ранее проведенные генетические тесты не позволили определить причину заболевания, но совокупность клинических признаков сохраняет подозрение на наследственное происхождение патологии.
Наиболее информативным вариантом является семейное исследование, при котором одновременно анализируется материал пациента и его родителей.
Сопоставление полученных результатов позволяет установить, является ли обнаруженный вариант унаследованным или возникшим впервые, а также оценить характер его передачи в семье.
В процессе анализа могут обнаруживаться изменения в генах, для которых на момент исследования отсутствует достаточная доказательная база для однозначной оценки их клинического значения. Такие находки требуют осторожной интерпретации и не могут рассматриваться как подтвержденная причина заболевания только на основании факта их выявления.
Значение результатов WES может изменяться по мере развития генетических исследований. Появление новых научных публикаций, расширение баз данных и пересмотр классификации генов и вариантов создают возможность повторной интерпретации ранее полученных результатов.
Поэтому данные полного секвенирования экзома в отдельных клинических ситуациях могут использоваться для повторного анализа с учетом актуальной информации, отсутствовавшей на момент первичного исследования.