ПТР әдісімен микросателлиттік тұрақсыздықты (MSI) анықтау
Бұл ісік жасушаларындағы ДНҚ-ны «жөндеу» жүйесінің қаншалықты дұрыс жұмыс істейтінін бағалауға көмектесетін молекулалық-генетикалық зерттеу.
Ағзаның әрбір жасушасында жасушалардың бөлінуі кезінде пайда болатын кездейсоқ қателерді үнемі түзетіп отыратын кіріктірілген механизм бар. Бұл механизм сәйкессіздіктерді репарациялау жүйесі (немесе ағылшынша mismatch repair — MMR) деп аталады.
Бұл жүйе дұрыс жұмыс істеуін тоқтатқан кезде, мысалы кейбір қатерлі ісік түрлерінде, қателер ДНҚ-ның микросателлиттер деп аталатын ерекше қысқа бөліктерінде жинала бастайды. Мұндай жағдай «микросателлиттік тұрақсыздық» (MSI) деп аталады.
ПТР әдісімен MSI талдауы ісіктің осы ерекшелігін анықтауға және дәрігерге ем тактикасы бойынша маңызды шешімдер қабылдауға көмектеседі.
Зерттеу әдісі:
Талдау полимеразды тізбекті реакция (ПТР) әдісімен, кейіннен арнайы құрылғы — генетикалық анализаторда ДНҚ фрагменттерін бөлу арқылы жүргізіледі. Әдіс халықаралық деңгейде танылған бес MSI маркерінің жағдайын жоғары дәлдікпен бағалауға мүмкіндік береді: BAT-25, BAT-26, NR-21, NR-24, NR-27.
Биоматериал:
Зерттеу үшін бұрын биопсия немесе операция кезінде алынған және парафин блогында сақталған ісік тіні (FFPE-материал деп аталатын) қолданылады. Пациенттен арнайы дайындық талап етілмейді.